| Place | State | Latitude | Longitude | Elevation (meters) | Elevation (feet) |
|---|
| Sisi | Departamento de (historical) Zelaya | 12.1 | -84.0333333 | 15 | 49 |
| Sisinata | Region Autonoma Atlantico Norte | 14.2833333 | -83.4833333 | 29 | 95 |
| Sitio Viejo | Departamento de Boaco | 12.4833333 | -85.9833333 | 418 | 1371 |
| Siuna | Region Autonoma Atlantico Norte | 13.7333333 | -84.7666667 | 210 | 689 |
| Skruwarban | Region Autonoma Atlantico Norte | 14.3333333 | -83.8 | 46 | 151 |
| Slilmasia | Region Autonoma Atlantico Norte | 14.6166667 | -83.9333333 | 149 | 489 |
| Soledad | Departamento de Rivas | 11.3666667 | -85.7833333 | 46 | 151 |
| Soledad | Region Autonoma Atlantico Sur | 12.0666667 | -84.25 | 24 | 79 |
| Soledad | Departamento de (historical) Zelaya | 12.0666667 | -84.25 | 24 | 79 |
| Soledad | Departamento de Managua | 12.0333333 | -86.6333333 | 31 | 102 |
| Somotillo | Departamento de Chinandega | 13.0333333 | -86.9166667 | 48 | 157 |
| Somoto | Departamento de Madriz | 13.4833333 | -86.5833333 | 704 | 2310 |
| Sonzapote | Departamento de Boaco | 12.4166667 | -85.7 | 460 | 1509 |
| Sonzapote | Departamento de Matagalpa | 12.65 | -85.8666667 | 413 | 1355 |
| Sotacaballo | Departamento de Rivas | 11.2333333 | -85.65 | 84 | 276 |
| Suak Suakia | Region Autonoma Atlantico Norte | 14.6166667 | -84.5 | 63 | 207 |
| Sucuya | Departamento de Rivas | 11.5166667 | -85.8333333 | 42 | 138 |
| Suni | Departamento de Jinotega | 13.15 | -86.1 | 964 | 3163 |
| Susucayan | Departamento de Nueva Segovia | 13.6666667 | -86.1666667 | 586 | 1923 |
| Susuli | Departamento de Matagalpa | 12.8166667 | -85.85 | 547 | 1795 |
